Terytorialny zasięg działania Naczelnika Urzędu Skarbowego w Bartoszycach obejmuje powiat bartoszycki i lidzbarski, w skład których wchodzą:

• Powiat Bartoszycki:

  • miasta: Bartoszyce, Górowo Iławeckie
  • gminy: Bartoszyce, Bisztynek, Górowo Iławeckie, Sępopol

• Powiat Lidzbarski:

  • miasto Lidzbark Warmiński
  • gminy: Lidzbark Warmiński, Kiwity, Lubomino, Orneta